Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrpxQ9R0M3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms