Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Nek3Q9R0A5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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