Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Rdh11Q9QYF1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Rdh11Q9QYF1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Rdh11Q9QYF1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Rdh11Q9QYF1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Rdh11Q9QYF1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh11Q9QYF1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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