Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms