Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms