Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms