Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cbx8Q9QXV1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms