Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms