Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacl1Q9QXE0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hacl1Q9QXE0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacl1Q9QXE0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacl1Q9QXE0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacl1Q9QXE0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms