Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms