Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Homer2Q9QWW1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms