Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms