Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms