Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms