Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms