Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RhoaQ9QUI0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhoaQ9QUI0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhoaQ9QUI0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhoaQ9QUI0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhoaQ9QUI0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhoaQ9QUI0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhoaQ9QUI0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhoaQ9QUI0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhoaQ9QUI0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RhoaQ9QUI0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhoaQ9QUI0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhoaQ9QUI0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms