Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms