Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms