Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaja4Q9JMC3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms