Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd2apQ9JLQ0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd2apQ9JLQ0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd2apQ9JLQ0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd2apQ9JLQ0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd2apQ9JLQ0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms