Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LitafQ9JLJ0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LitafQ9JLJ0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LitafQ9JLJ0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LitafQ9JLJ0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LitafQ9JLJ0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LitafQ9JLJ0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LitafQ9JLJ0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LitafQ9JLJ0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LitafQ9JLJ0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LitafQ9JLJ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LitafQ9JLJ0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LitafQ9JLJ0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LitafQ9JLJ0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LitafQ9JLJ0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LitafQ9JLJ0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms