Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms