Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msrb1Q9JLC3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms