Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms