Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms