Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms