Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod2Q9JKK7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmod2Q9JKK7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms