Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms