Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms