Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms