Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms