Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms