Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1fQ9JIS7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1fQ9JIS7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1fQ9JIS7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1fQ9JIS7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1fQ9JIS7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1fQ9JIS7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1fQ9JIS7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1fQ9JIS7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1fQ9JIS7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1fQ9JIS7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1fQ9JIS7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1fQ9JIS7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1fQ9JIS7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cacna1fQ9JIS7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cacna1fQ9JIS7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna1fQ9JIS7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1fQ9JIS7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1fQ9JIS7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1fQ9JIS7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1fQ9JIS7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1fQ9JIS7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1fQ9JIS7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1fQ9JIS7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna1fQ9JIS7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna1fQ9JIS7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna1fQ9JIS7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms