Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnmb4Q9JIN6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms