Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Praf2Q9JIG8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms