Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms