Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EefsecQ9JHW4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EefsecQ9JHW4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EefsecQ9JHW4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EefsecQ9JHW4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EefsecQ9JHW4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EefsecQ9JHW4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EefsecQ9JHW4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EefsecQ9JHW4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EefsecQ9JHW4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EefsecQ9JHW4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EefsecQ9JHW4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EefsecQ9JHW4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EefsecQ9JHW4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EefsecQ9JHW4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms