Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms