Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms