Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms