Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r48Q9EQ52 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r48Q9EQ52 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms