Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms