Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ropn1lQ9EQ00 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms