Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms