Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms