Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms