Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms