Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Swt1Q9DBQ9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms