Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tysnd1Q9DBA6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tysnd1Q9DBA6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tysnd1Q9DBA6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tysnd1Q9DBA6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tysnd1Q9DBA6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tysnd1Q9DBA6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tysnd1Q9DBA6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tysnd1Q9DBA6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tysnd1Q9DBA6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tysnd1Q9DBA6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tysnd1Q9DBA6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tysnd1Q9DBA6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tysnd1Q9DBA6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms