Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms